Protein–RNA interactions for Protein: P50135

HNMT, Histamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNMTP50135 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HNMTP50135 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HNMTP50135 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HNMTP50135 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HNMTP50135 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HNMTP50135 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HNMTP50135 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HNMTP50135 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HNMTP50135 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HNMTP50135 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HNMTP50135 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HNMTP50135 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HNMTP50135 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HNMTP50135 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HNMTP50135 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HNMTP50135 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HNMTP50135 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HNMTP50135 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HNMTP50135 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HNMTP50135 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HNMTP50135 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HNMTP50135 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HNMTP50135 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HNMTP50135 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HNMTP50135 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HNMTP50135 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HNMTP50135 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HNMTP50135 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HNMTP50135 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HNMTP50135 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HNMTP50135 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HNMTP50135 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HNMTP50135 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HNMTP50135 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HNMTP50135 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HNMTP50135 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HNMTP50135 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNMTP50135 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNMTP50135 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNMTP50135 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNMTP50135 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNMTP50135 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HNMTP50135 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HNMTP50135 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HNMTP50135 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HNMTP50135 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HNMTP50135 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HNMTP50135 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HNMTP50135 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HNMTP50135 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HNMTP50135 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HNMTP50135 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HNMTP50135 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HNMTP50135 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HNMTP50135 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HNMTP50135 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HNMTP50135 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HNMTP50135 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HNMTP50135 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HNMTP50135 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HNMTP50135 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HNMTP50135 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HNMTP50135 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HNMTP50135 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
HNMTP50135 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HNMTP50135 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HNMTP50135 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HNMTP50135 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HNMTP50135 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HNMTP50135 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HNMTP50135 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HNMTP50135 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HNMTP50135 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HNMTP50135 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HNMTP50135 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HNMTP50135 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HNMTP50135 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HNMTP50135 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HNMTP50135 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HNMTP50135 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HNMTP50135 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HNMTP50135 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HNMTP50135 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HNMTP50135 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNMTP50135 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNMTP50135 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNMTP50135 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HNMTP50135 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNMTP50135 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNMTP50135 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNMTP50135 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNMTP50135 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNMTP50135 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNMTP50135 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNMTP50135 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNMTP50135 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNMTP50135 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HNMTP50135 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HNMTP50135 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HNMTP50135 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms