Protein–RNA interactions for Protein: P48723

HSPA13, Heat shock 70 kDa protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA13P48723 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSPA13P48723 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSPA13P48723 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSPA13P48723 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSPA13P48723 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSPA13P48723 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSPA13P48723 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSPA13P48723 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSPA13P48723 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSPA13P48723 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HSPA13P48723 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSPA13P48723 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSPA13P48723 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSPA13P48723 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSPA13P48723 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPA13P48723 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPA13P48723 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPA13P48723 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSPA13P48723 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPA13P48723 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPA13P48723 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSPA13P48723 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA13P48723 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA13P48723 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA13P48723 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA13P48723 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA13P48723 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA13P48723 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA13P48723 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA13P48723 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA13P48723 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA13P48723 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA13P48723 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HSPA13P48723 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSPA13P48723 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSPA13P48723 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSPA13P48723 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPA13P48723 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPA13P48723 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPA13P48723 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPA13P48723 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPA13P48723 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPA13P48723 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPA13P48723 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPA13P48723 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSPA13P48723 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSPA13P48723 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPA13P48723 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1034.3 ms