Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA2P47869 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA2P47869 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA2P47869 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms