Protein–RNA interactions for Protein: P40926

MDH2, Malate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH2P40926 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH2P40926 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH2P40926 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH2P40926 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MDH2P40926 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDH2P40926 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDH2P40926 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MDH2P40926 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDH2P40926 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDH2P40926 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDH2P40926 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDH2P40926 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDH2P40926 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDH2P40926 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDH2P40926 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDH2P40926 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDH2P40926 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDH2P40926 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDH2P40926 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDH2P40926 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDH2P40926 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDH2P40926 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDH2P40926 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDH2P40926 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDH2P40926 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDH2P40926 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDH2P40926 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH2P40926 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH2P40926 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH2P40926 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH2P40926 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH2P40926 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MDH2P40926 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDH2P40926 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDH2P40926 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDH2P40926 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDH2P40926 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDH2P40926 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDH2P40926 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDH2P40926 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDH2P40926 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDH2P40926 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDH2P40926 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDH2P40926 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH2P40926 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH2P40926 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH2P40926 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH2P40926 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH2P40926 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH2P40926 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH2P40926 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH2P40926 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH2P40926 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH2P40926 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH2P40926 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH2P40926 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH2P40926 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH2P40926 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH2P40926 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH2P40926 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH2P40926 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH2P40926 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH2P40926 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH2P40926 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH2P40926 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH2P40926 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH2P40926 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH2P40926 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH2P40926 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH2P40926 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDH2P40926 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDH2P40926 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDH2P40926 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDH2P40926 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH2P40926 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH2P40926 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH2P40926 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH2P40926 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH2P40926 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH2P40926 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH2P40926 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDH2P40926 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDH2P40926 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH2P40926 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH2P40926 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH2P40926 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH2P40926 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH2P40926 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH2P40926 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH2P40926 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH2P40926 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDH2P40926 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDH2P40926 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDH2P40926 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH2P40926 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH2P40926 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH2P40926 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH2P40926 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH2P40926 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDH2P40926 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms