Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA7P36544 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA7P36544 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA7P36544 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA7P36544 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA7P36544 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA7P36544 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA7P36544 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA7P36544 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA7P36544 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA7P36544 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA7P36544 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA7P36544 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA7P36544 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA7P36544 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA7P36544 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA7P36544 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNA7P36544 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNA7P36544 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms