Protein–RNA interactions for Protein: P31025

LCN1, Lipocalin-1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P31025 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCN1P31025 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCN1P31025 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCN1P31025 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCN1P31025 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCN1P31025 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN1P31025 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN1P31025 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCN1P31025 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCN1P31025 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCN1P31025 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCN1P31025 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCN1P31025 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCN1P31025 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LCN1P31025 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCN1P31025 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCN1P31025 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCN1P31025 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LCN1P31025 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LCN1P31025 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCN1P31025 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LCN1P31025 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCN1P31025 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCN1P31025 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN1P31025 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN1P31025 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN1P31025 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN1P31025 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN1P31025 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN1P31025 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN1P31025 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN1P31025 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN1P31025 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN1P31025 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN1P31025 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCN1P31025 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCN1P31025 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCN1P31025 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCN1P31025 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCN1P31025 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN1P31025 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN1P31025 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN1P31025 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN1P31025 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN1P31025 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCN1P31025 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCN1P31025 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LCN1P31025 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LCN1P31025 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCN1P31025 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCN1P31025 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LCN1P31025 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCN1P31025 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN1P31025 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN1P31025 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN1P31025 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN1P31025 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCN1P31025 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCN1P31025 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCN1P31025 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LCN1P31025 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCN1P31025 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCN1P31025 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCN1P31025 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCN1P31025 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCN1P31025 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCN1P31025 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCN1P31025 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LCN1P31025 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCN1P31025 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCN1P31025 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCN1P31025 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCN1P31025 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCN1P31025 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN1P31025 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN1P31025 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN1P31025 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN1P31025 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN1P31025 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCN1P31025 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCN1P31025 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCN1P31025 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LCN1P31025 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCN1P31025 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCN1P31025 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LCN1P31025 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LCN1P31025 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN1P31025 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN1P31025 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN1P31025 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN1P31025 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCN1P31025 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCN1P31025 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCN1P31025 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCN1P31025 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCN1P31025 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCN1P31025 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LCN1P31025 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCN1P31025 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LCN1P31025 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms