Protein–RNA interactions for Protein: P22735

TGM1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM1P22735 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TGM1P22735 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TGM1P22735 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TGM1P22735 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TGM1P22735 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TGM1P22735 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TGM1P22735 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TGM1P22735 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TGM1P22735 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TGM1P22735 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TGM1P22735 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TGM1P22735 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TGM1P22735 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGM1P22735 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGM1P22735 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGM1P22735 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGM1P22735 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGM1P22735 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGM1P22735 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGM1P22735 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGM1P22735 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGM1P22735 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGM1P22735 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGM1P22735 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGM1P22735 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGM1P22735 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGM1P22735 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGM1P22735 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGM1P22735 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TGM1P22735 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TGM1P22735 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TGM1P22735 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TGM1P22735 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGM1P22735 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGM1P22735 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TGM1P22735 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TGM1P22735 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TGM1P22735 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGM1P22735 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGM1P22735 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TGM1P22735 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGM1P22735 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TGM1P22735 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGM1P22735 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGM1P22735 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGM1P22735 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGM1P22735 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGM1P22735 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGM1P22735 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGM1P22735 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGM1P22735 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGM1P22735 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGM1P22735 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGM1P22735 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGM1P22735 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGM1P22735 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGM1P22735 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGM1P22735 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TGM1P22735 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TGM1P22735 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TGM1P22735 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TGM1P22735 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TGM1P22735 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TGM1P22735 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGM1P22735 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGM1P22735 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGM1P22735 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGM1P22735 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGM1P22735 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGM1P22735 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGM1P22735 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TGM1P22735 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGM1P22735 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGM1P22735 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGM1P22735 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGM1P22735 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGM1P22735 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGM1P22735 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGM1P22735 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGM1P22735 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TGM1P22735 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TGM1P22735 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TGM1P22735 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGM1P22735 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGM1P22735 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGM1P22735 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGM1P22735 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGM1P22735 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGM1P22735 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGM1P22735 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGM1P22735 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGM1P22735 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGM1P22735 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TGM1P22735 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGM1P22735 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGM1P22735 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGM1P22735 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGM1P22735 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGM1P22735 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TGM1P22735 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms