Protein–RNA interactions for Protein: P22459

KCNA4, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA4P22459 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA4P22459 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA4P22459 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA4P22459 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNA4P22459 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNA4P22459 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNA4P22459 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA4P22459 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA4P22459 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA4P22459 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNA4P22459 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNA4P22459 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA4P22459 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA4P22459 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA4P22459 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA4P22459 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA4P22459 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA4P22459 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA4P22459 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA4P22459 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA4P22459 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA4P22459 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA4P22459 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA4P22459 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA4P22459 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNA4P22459 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNA4P22459 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNA4P22459 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNA4P22459 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNA4P22459 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNA4P22459 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNA4P22459 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNA4P22459 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNA4P22459 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNA4P22459 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNA4P22459 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNA4P22459 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNA4P22459 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNA4P22459 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
KCNA4P22459 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNA4P22459 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNA4P22459 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNA4P22459 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNA4P22459 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNA4P22459 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNA4P22459 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms