Protein–RNA interactions for Protein: P22105

TNXB, Tenascin-X, humanhuman

Predictions only

Length 4,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXBP22105 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXBP22105 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXBP22105 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXBP22105 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXBP22105 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXBP22105 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXBP22105 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXBP22105 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXBP22105 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXBP22105 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXBP22105 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXBP22105 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXBP22105 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXBP22105 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXBP22105 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXBP22105 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXBP22105 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXBP22105 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXBP22105 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXBP22105 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXBP22105 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXBP22105 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXBP22105 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXBP22105 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXBP22105 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXBP22105 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXBP22105 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXBP22105 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXBP22105 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXBP22105 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNXBP22105 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXBP22105 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXBP22105 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNXBP22105 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNXBP22105 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNXBP22105 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNXBP22105 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNXBP22105 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNXBP22105 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNXBP22105 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNXBP22105 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNXBP22105 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNXBP22105 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNXBP22105 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNXBP22105 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNXBP22105 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNXBP22105 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXBP22105 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXBP22105 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXBP22105 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXBP22105 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXBP22105 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXBP22105 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXBP22105 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXBP22105 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXBP22105 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXBP22105 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXBP22105 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXBP22105 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXBP22105 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXBP22105 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXBP22105 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXBP22105 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXBP22105 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNXBP22105 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNXBP22105 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNXBP22105 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNXBP22105 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXBP22105 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXBP22105 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXBP22105 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXBP22105 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXBP22105 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXBP22105 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXBP22105 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXBP22105 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXBP22105 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXBP22105 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXBP22105 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXBP22105 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXBP22105 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXBP22105 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXBP22105 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXBP22105 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXBP22105 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXBP22105 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXBP22105 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXBP22105 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXBP22105 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXBP22105 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXBP22105 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXBP22105 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXBP22105 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXBP22105 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXBP22105 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXBP22105 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXBP22105 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXBP22105 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXBP22105 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXBP22105 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms