Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CKMT2P17540 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CKMT2P17540 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CKMT2P17540 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CKMT2P17540 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CKMT2P17540 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKMT2P17540 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKMT2P17540 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKMT2P17540 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CKMT2P17540 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CKMT2P17540 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKMT2P17540 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKMT2P17540 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms