Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A2P16615 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2A2P16615 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2A2P16615 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2A2P16615 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2A2P16615 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2A2P16615 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2A2P16615 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP2A2P16615 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2A2P16615 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2A2P16615 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2A2P16615 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2A2P16615 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2A2P16615 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2A2P16615 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2A2P16615 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP2A2P16615 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP2A2P16615 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2A2P16615 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2A2P16615 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2A2P16615 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2A2P16615 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2A2P16615 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2A2P16615 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2A2P16615 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2A2P16615 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2A2P16615 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2A2P16615 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2A2P16615 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2A2P16615 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2A2P16615 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2A2P16615 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2A2P16615 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2A2P16615 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2A2P16615 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2A2P16615 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2A2P16615 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2A2P16615 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2A2P16615 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2A2P16615 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2A2P16615 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2A2P16615 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2A2P16615 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2A2P16615 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2A2P16615 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms