Protein–RNA interactions for Protein: P06312

IGKV4-1, Immunoglobulin kappa variable 4-1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV4-1P06312 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGKV4-1P06312 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV4-1P06312 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV4-1P06312 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms