Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKCGP05129 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCGP05129 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCGP05129 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCGP05129 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCGP05129 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCGP05129 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCGP05129 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCGP05129 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCGP05129 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms