Protein–RNA interactions for Protein: P01817

IGHV2-5, Immunoglobulin heavy variable 2-5, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV2-5P01817 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV2-5P01817 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV2-5P01817 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV2-5P01817 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGHV2-5P01817 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms