Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED1O96006 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZBED1O96006 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED1O96006 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED1O96006 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED1O96006 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED1O96006 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED1O96006 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED1O96006 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED1O96006 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED1O96006 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED1O96006 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED1O96006 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED1O96006 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED1O96006 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED1O96006 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED1O96006 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED1O96006 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED1O96006 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED1O96006 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED1O96006 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZBED1O96006 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED1O96006 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED1O96006 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED1O96006 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED1O96006 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED1O96006 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZBED1O96006 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms