Protein–RNA interactions for Protein: O95793

STAU1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU1O95793 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAU1O95793 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAU1O95793 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STAU1O95793 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STAU1O95793 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STAU1O95793 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STAU1O95793 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAU1O95793 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAU1O95793 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STAU1O95793 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STAU1O95793 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
STAU1O95793 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STAU1O95793 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
STAU1O95793 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
STAU1O95793 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STAU1O95793 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STAU1O95793 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STAU1O95793 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STAU1O95793 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STAU1O95793 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STAU1O95793 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STAU1O95793 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STAU1O95793 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STAU1O95793 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STAU1O95793 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STAU1O95793 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STAU1O95793 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STAU1O95793 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STAU1O95793 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STAU1O95793 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STAU1O95793 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STAU1O95793 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STAU1O95793 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STAU1O95793 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STAU1O95793 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAU1O95793 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STAU1O95793 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STAU1O95793 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAU1O95793 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAU1O95793 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAU1O95793 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAU1O95793 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAU1O95793 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAU1O95793 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAU1O95793 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAU1O95793 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAU1O95793 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAU1O95793 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAU1O95793 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAU1O95793 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAU1O95793 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAU1O95793 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAU1O95793 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAU1O95793 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAU1O95793 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAU1O95793 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAU1O95793 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAU1O95793 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAU1O95793 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
STAU1O95793 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
STAU1O95793 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STAU1O95793 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAU1O95793 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAU1O95793 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAU1O95793 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
STAU1O95793 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
STAU1O95793 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAU1O95793 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAU1O95793 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAU1O95793 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAU1O95793 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAU1O95793 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAU1O95793 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAU1O95793 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAU1O95793 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAU1O95793 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAU1O95793 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAU1O95793 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
STAU1O95793 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAU1O95793 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAU1O95793 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAU1O95793 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
STAU1O95793 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAU1O95793 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAU1O95793 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAU1O95793 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAU1O95793 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAU1O95793 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAU1O95793 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAU1O95793 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAU1O95793 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
STAU1O95793 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAU1O95793 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAU1O95793 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAU1O95793 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAU1O95793 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAU1O95793 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAU1O95793 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAU1O95793 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STAU1O95793 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms