Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAMBPO95630 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAMBPO95630 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAMBPO95630 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAMBPO95630 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAMBPO95630 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPO95630 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPO95630 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPO95630 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STAMBPO95630 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STAMBPO95630 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STAMBPO95630 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAMBPO95630 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAMBPO95630 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAMBPO95630 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAMBPO95630 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAMBPO95630 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAMBPO95630 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAMBPO95630 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAMBPO95630 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAMBPO95630 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPO95630 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPO95630 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPO95630 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAMBPO95630 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAMBPO95630 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAMBPO95630 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
STAMBPO95630 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STAMBPO95630 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAMBPO95630 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAMBPO95630 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAMBPO95630 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAMBPO95630 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAMBPO95630 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAMBPO95630 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAMBPO95630 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
STAMBPO95630 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STAMBPO95630 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STAMBPO95630 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STAMBPO95630 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STAMBPO95630 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STAMBPO95630 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STAMBPO95630 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STAMBPO95630 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STAMBPO95630 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms