Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX3O95076 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX3O95076 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX3O95076 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX3O95076 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX3O95076 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX3O95076 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX3O95076 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX3O95076 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX3O95076 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX3O95076 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX3O95076 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX3O95076 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX3O95076 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX3O95076 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX3O95076 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX3O95076 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX3O95076 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX3O95076 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX3O95076 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX3O95076 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX3O95076 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALX3O95076 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALX3O95076 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALX3O95076 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX3O95076 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX3O95076 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX3O95076 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX3O95076 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX3O95076 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX3O95076 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX3O95076 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX3O95076 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX3O95076 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX3O95076 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX3O95076 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX3O95076 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX3O95076 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX3O95076 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX3O95076 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX3O95076 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX3O95076 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX3O95076 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX3O95076 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX3O95076 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALX3O95076 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALX3O95076 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX3O95076 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX3O95076 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX3O95076 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX3O95076 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX3O95076 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX3O95076 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX3O95076 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX3O95076 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX3O95076 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX3O95076 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX3O95076 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX3O95076 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX3O95076 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX3O95076 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX3O95076 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX3O95076 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX3O95076 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX3O95076 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX3O95076 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX3O95076 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX3O95076 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX3O95076 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ALX3O95076 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX3O95076 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX3O95076 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX3O95076 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX3O95076 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX3O95076 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX3O95076 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX3O95076 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX3O95076 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX3O95076 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX3O95076 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX3O95076 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX3O95076 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX3O95076 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ALX3O95076 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX3O95076 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX3O95076 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX3O95076 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX3O95076 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX3O95076 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX3O95076 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX3O95076 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX3O95076 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX3O95076 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX3O95076 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX3O95076 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX3O95076 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX3O95076 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX3O95076 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX3O95076 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX3O95076 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms