Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEBLO76041 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEBLO76041 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEBLO76041 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEBLO76041 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEBLO76041 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEBLO76041 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEBLO76041 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEBLO76041 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEBLO76041 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEBLO76041 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEBLO76041 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEBLO76041 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEBLO76041 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEBLO76041 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEBLO76041 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEBLO76041 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEBLO76041 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEBLO76041 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEBLO76041 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEBLO76041 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEBLO76041 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEBLO76041 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEBLO76041 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEBLO76041 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEBLO76041 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEBLO76041 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEBLO76041 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NEBLO76041 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEBLO76041 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NEBLO76041 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEBLO76041 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEBLO76041 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NEBLO76041 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEBLO76041 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEBLO76041 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEBLO76041 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEBLO76041 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEBLO76041 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEBLO76041 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEBLO76041 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEBLO76041 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEBLO76041 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEBLO76041 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEBLO76041 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEBLO76041 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEBLO76041 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NEBLO76041 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEBLO76041 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEBLO76041 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEBLO76041 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEBLO76041 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEBLO76041 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NEBLO76041 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NEBLO76041 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEBLO76041 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEBLO76041 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEBLO76041 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEBLO76041 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEBLO76041 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEBLO76041 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEBLO76041 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEBLO76041 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NEBLO76041 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEBLO76041 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEBLO76041 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEBLO76041 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEBLO76041 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEBLO76041 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEBLO76041 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEBLO76041 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEBLO76041 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEBLO76041 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEBLO76041 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEBLO76041 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NEBLO76041 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEBLO76041 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEBLO76041 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEBLO76041 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEBLO76041 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEBLO76041 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NEBLO76041 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEBLO76041 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEBLO76041 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEBLO76041 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEBLO76041 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEBLO76041 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEBLO76041 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEBLO76041 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEBLO76041 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEBLO76041 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEBLO76041 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEBLO76041 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEBLO76041 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEBLO76041 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEBLO76041 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEBLO76041 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEBLO76041 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEBLO76041 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEBLO76041 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms