Protein–RNA interactions for Protein: O75971

SNAPC5, snRNA-activating protein complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC5O75971 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAPC5O75971 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAPC5O75971 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAPC5O75971 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAPC5O75971 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms