Protein–RNA interactions for Protein: O75969

AKAP3, A-kinase anchor protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP3O75969 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AKAP3O75969 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AKAP3O75969 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AKAP3O75969 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AKAP3O75969 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AKAP3O75969 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AKAP3O75969 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AKAP3O75969 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AKAP3O75969 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AKAP3O75969 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
AKAP3O75969 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AKAP3O75969 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AKAP3O75969 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
AKAP3O75969 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AKAP3O75969 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AKAP3O75969 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AKAP3O75969 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
AKAP3O75969 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AKAP3O75969 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AKAP3O75969 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AKAP3O75969 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AKAP3O75969 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AKAP3O75969 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AKAP3O75969 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP3O75969 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP3O75969 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AKAP3O75969 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AKAP3O75969 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
AKAP3O75969 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AKAP3O75969 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AKAP3O75969 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AKAP3O75969 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AKAP3O75969 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AKAP3O75969 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AKAP3O75969 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AKAP3O75969 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms