Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM24O75264 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM24O75264 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM24O75264 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM24O75264 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM24O75264 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM24O75264 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM24O75264 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMIM24O75264 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMIM24O75264 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM24O75264 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMIM24O75264 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMIM24O75264 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM24O75264 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM24O75264 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM24O75264 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM24O75264 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM24O75264 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM24O75264 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM24O75264 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM24O75264 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM24O75264 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM24O75264 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM24O75264 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM24O75264 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM24O75264 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM24O75264 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM24O75264 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM24O75264 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms