Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBNO60934 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBNO60934 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBNO60934 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NBNO60934 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NBNO60934 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBNO60934 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBNO60934 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NBNO60934 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NBNO60934 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NBNO60934 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NBNO60934 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NBNO60934 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NBNO60934 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NBNO60934 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NBNO60934 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NBNO60934 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBNO60934 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBNO60934 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBNO60934 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBNO60934 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBNO60934 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBNO60934 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBNO60934 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBNO60934 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBNO60934 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBNO60934 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBNO60934 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBNO60934 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBNO60934 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBNO60934 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBNO60934 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBNO60934 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBNO60934 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBNO60934 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBNO60934 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NBNO60934 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NBNO60934 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBNO60934 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBNO60934 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBNO60934 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBNO60934 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBNO60934 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NBNO60934 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBNO60934 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBNO60934 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBNO60934 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBNO60934 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBNO60934 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBNO60934 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBNO60934 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBNO60934 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBNO60934 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBNO60934 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NBNO60934 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NBNO60934 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBNO60934 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBNO60934 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBNO60934 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBNO60934 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBNO60934 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBNO60934 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBNO60934 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBNO60934 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBNO60934 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBNO60934 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBNO60934 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBNO60934 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBNO60934 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBNO60934 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBNO60934 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBNO60934 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBNO60934 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBNO60934 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBNO60934 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBNO60934 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBNO60934 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBNO60934 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBNO60934 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBNO60934 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBNO60934 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBNO60934 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBNO60934 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBNO60934 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBNO60934 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBNO60934 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBNO60934 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBNO60934 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NBNO60934 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBNO60934 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBNO60934 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBNO60934 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBNO60934 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBNO60934 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBNO60934 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NBNO60934 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBNO60934 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBNO60934 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBNO60934 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBNO60934 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms