Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PLXNC1O60486 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PLXNC1O60486 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PLXNC1O60486 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PLXNC1O60486 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PLXNC1O60486 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PLXNC1O60486 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
PLXNC1O60486 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
PLXNC1O60486 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
PLXNC1O60486 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
PLXNC1O60486 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PLXNC1O60486 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
PLXNC1O60486 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PLXNC1O60486 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PLXNC1O60486 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PLXNC1O60486 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PLXNC1O60486 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
PLXNC1O60486 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
PLXNC1O60486 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.02■■■■■ 4
PLXNC1O60486 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.02■■■■■ 4
PLXNC1O60486 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC40.02■■■■■ 4
PLXNC1O60486 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC40.02■■■■■ 4
PLXNC1O60486 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC40.02■■■■■ 4
PLXNC1O60486 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC40.02■■■■■ 4
PLXNC1O60486 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC40.02■■■■■ 4
PLXNC1O60486 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC40.02■■■■■ 4
PLXNC1O60486 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC40.02■■■■■ 4
PLXNC1O60486 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
PLXNC1O60486 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■□ 3.99
PLXNC1O60486 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
PLXNC1O60486 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PLXNC1O60486 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PLXNC1O60486 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PLXNC1O60486 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PLXNC1O60486 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PLXNC1O60486 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PLXNC1O60486 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PLXNC1O60486 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PLXNC1O60486 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PLXNC1O60486 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
PLXNC1O60486 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PLXNC1O60486 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PLXNC1O60486 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
PLXNC1O60486 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PLXNC1O60486 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PLXNC1O60486 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PLXNC1O60486 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PLXNC1O60486 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PLXNC1O60486 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
PLXNC1O60486 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
PLXNC1O60486 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
PLXNC1O60486 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
PLXNC1O60486 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PLXNC1O60486 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PLXNC1O60486 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PLXNC1O60486 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PLXNC1O60486 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PLXNC1O60486 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PLXNC1O60486 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PLXNC1O60486 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
PLXNC1O60486 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PLXNC1O60486 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
PLXNC1O60486 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PLXNC1O60486 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PLXNC1O60486 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PLXNC1O60486 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PLXNC1O60486 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PLXNC1O60486 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PLXNC1O60486 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PLXNC1O60486 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PLXNC1O60486 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PLXNC1O60486 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PLXNC1O60486 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
PLXNC1O60486 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
PLXNC1O60486 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PLXNC1O60486 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PLXNC1O60486 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PLXNC1O60486 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PLXNC1O60486 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PLXNC1O60486 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
PLXNC1O60486 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
PLXNC1O60486 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms