Protein–RNA interactions for Protein: O43837

IDH3B, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3BO43837 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IDH3BO43837 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IDH3BO43837 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IDH3BO43837 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IDH3BO43837 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IDH3BO43837 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IDH3BO43837 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IDH3BO43837 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IDH3BO43837 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IDH3BO43837 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IDH3BO43837 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IDH3BO43837 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IDH3BO43837 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IDH3BO43837 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IDH3BO43837 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IDH3BO43837 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IDH3BO43837 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms