Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASA4O43374 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASA4O43374 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RASA4O43374 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASA4O43374 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RASA4O43374 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASA4O43374 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASA4O43374 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASA4O43374 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASA4O43374 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASA4O43374 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASA4O43374 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASA4O43374 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RASA4O43374 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RASA4O43374 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RASA4O43374 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RASA4O43374 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RASA4O43374 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RASA4O43374 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASA4O43374 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASA4O43374 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RASA4O43374 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RASA4O43374 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RASA4O43374 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RASA4O43374 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RASA4O43374 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RASA4O43374 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RASA4O43374 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASA4O43374 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RASA4O43374 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASA4O43374 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RASA4O43374 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RASA4O43374 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RASA4O43374 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RASA4O43374 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RASA4O43374 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASA4O43374 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASA4O43374 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASA4O43374 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASA4O43374 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASA4O43374 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASA4O43374 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASA4O43374 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RASA4O43374 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RASA4O43374 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RASA4O43374 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RASA4O43374 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RASA4O43374 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RASA4O43374 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RASA4O43374 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RASA4O43374 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RASA4O43374 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RASA4O43374 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RASA4O43374 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASA4O43374 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASA4O43374 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASA4O43374 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASA4O43374 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASA4O43374 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASA4O43374 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASA4O43374 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASA4O43374 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RASA4O43374 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RASA4O43374 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASA4O43374 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASA4O43374 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASA4O43374 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASA4O43374 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASA4O43374 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASA4O43374 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASA4O43374 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASA4O43374 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RASA4O43374 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RASA4O43374 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASA4O43374 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASA4O43374 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASA4O43374 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASA4O43374 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASA4O43374 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASA4O43374 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASA4O43374 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASA4O43374 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASA4O43374 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASA4O43374 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASA4O43374 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RASA4O43374 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RASA4O43374 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RASA4O43374 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASA4O43374 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASA4O43374 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASA4O43374 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASA4O43374 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASA4O43374 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASA4O43374 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASA4O43374 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RASA4O43374 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RASA4O43374 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RASA4O43374 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RASA4O43374 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RASA4O43374 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms