Protein–RNA interactions for Protein: O43301

HSPA12A, Heat shock 70 kDa protein 12A, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA12AO43301 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPA12AO43301 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPA12AO43301 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPA12AO43301 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSPA12AO43301 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms