Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM25AB3EWG3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM25AB3EWG3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM25AB3EWG3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM25AB3EWG3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM25AB3EWG3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM25AB3EWG3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM25AB3EWG3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM25AB3EWG3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM25AB3EWG3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM25AB3EWG3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM25AB3EWG3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM25AB3EWG3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM25AB3EWG3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM25AB3EWG3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM25AB3EWG3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM25AB3EWG3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM25AB3EWG3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM25AB3EWG3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms