Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX3A6NHT5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMX3A6NHT5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMX3A6NHT5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMX3A6NHT5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms