Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT87PA6NCN2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT87PA6NCN2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT87PA6NCN2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT87PA6NCN2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT87PA6NCN2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms