Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC66A2RUB6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC66A2RUB6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC66A2RUB6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC66A2RUB6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC66A2RUB6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC66A2RUB6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC66A2RUB6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC66A2RUB6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC66A2RUB6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC66A2RUB6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC66A2RUB6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC66A2RUB6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC66A2RUB6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC66A2RUB6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC66A2RUB6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC66A2RUB6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC66A2RUB6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC66A2RUB6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC66A2RUB6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC66A2RUB6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC66A2RUB6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC66A2RUB6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC66A2RUB6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC66A2RUB6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC66A2RUB6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC66A2RUB6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC66A2RUB6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC66A2RUB6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC66A2RUB6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC66A2RUB6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC66A2RUB6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC66A2RUB6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC66A2RUB6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC66A2RUB6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC66A2RUB6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms