Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
A0A1W2PPC1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A1W2PPC1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A1W2PPC1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
A0A1W2PPC1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
A0A1W2PPC1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
A0A1W2PPC1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A1W2PPC1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A1W2PPC1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A1W2PPC1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
A0A1W2PPC1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
A0A1W2PPC1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
A0A1W2PPC1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms