Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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RRN3P1Q2M238 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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RRN3P1Q2M238 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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