RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498940.1

LINC00682-201, long intergenic non-protein coding RNA 682, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC00682, Length 1,625 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00682-201ENST00000498940 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.67■■■■■ 5.54
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LINC00682-201ENST00000498940 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.17■■■■■ 4.18
LINC00682-201ENST00000498940 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.15■■■■■ 4.18
LINC00682-201ENST00000498940 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.06■■■■■ 4.16
LINC00682-201ENST00000498940 NACADO15069 1562 aa41■■■■■ 4.15
LINC00682-201ENST00000498940 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.83■■■■■ 4.13
LINC00682-201ENST00000498940 SCRIBQ14160 1630 aa39.97■■■■□ 3.99
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LINC00682-201ENST00000498940 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.53■■■■□ 3.92
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LINC00682-201ENST00000498940 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.45■■■■□ 3.75
LINC00682-201ENST00000498940 SMARCA4P51532 1647 aa38.34■■■■□ 3.73
LINC00682-201ENST00000498940 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.26■■■■□ 3.72
LINC00682-201ENST00000498940 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
LINC00682-201ENST00000498940 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.07■■■■□ 3.68
LINC00682-201ENST00000498940 PEG3Q9GZU2 1588 aa38■■■■□ 3.67
LINC00682-201ENST00000498940 SMARCA2P51531 1590 aa37.96■■■■□ 3.67
LINC00682-201ENST00000498940 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.95■■■■□ 3.67
LINC00682-201ENST00000498940 WIZO95785 1651 aa37.87■■■■□ 3.65
LINC00682-201ENST00000498940 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.85■■■■□ 3.65
LINC00682-201ENST00000498940 NCAPD3P42695 1498 aa37.83■■■■□ 3.65
LINC00682-201ENST00000498940 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
LINC00682-201ENST00000498940 HMGXB3Q12766 1538 aa37.71■■■■□ 3.63
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LINC00682-201ENST00000498940 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
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LINC00682-201ENST00000498940 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.77■■■■□ 3.48
LINC00682-201ENST00000498940 CFTRP13569 1480 aa36.72■■■■□ 3.47
LINC00682-201ENST00000498940 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.69■■■■□ 3.46
LINC00682-201ENST00000498940 NESP48681 1621 aa36.6■■■■□ 3.45
LINC00682-201ENST00000498940 PRDM2Q13029 1718 aa36.45■■■■□ 3.43
LINC00682-201ENST00000498940 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.44■■■■□ 3.42
LINC00682-201ENST00000498940 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.33■■■■□ 3.41
LINC00682-201ENST00000498940 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.21■■■■□ 3.39
LINC00682-201ENST00000498940 ERCC6Q03468 1493 aa36.2■■■■□ 3.39
LINC00682-201ENST00000498940 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.18■■■■□ 3.38
LINC00682-201ENST00000498940 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.98■■■■□ 3.35
LINC00682-201ENST00000498940 ABCC8Q09428 1581 aa35.96■■■■□ 3.35
LINC00682-201ENST00000498940 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.96■■■■□ 3.35
LINC00682-201ENST00000498940 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
LINC00682-201ENST00000498940 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
LINC00682-201ENST00000498940 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.86■■■■□ 3.33
LINC00682-201ENST00000498940 CUX1P39880 1505 aa35.85■■■■□ 3.33
LINC00682-201ENST00000498940 WDR62O43379 1518 aa35.84■■■■□ 3.33
LINC00682-201ENST00000498940 TOPBP1Q92547 1522 aa35.83■■■■□ 3.33
LINC00682-201ENST00000498940 TOP2BQ02880 1626 aa35.77■■■■□ 3.32
LINC00682-201ENST00000498940 SYNJ1O43426 1573 aa35.77■■■■□ 3.32
LINC00682-201ENST00000498940 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.75■■■■□ 3.31
LINC00682-201ENST00000498940 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.75■■■■□ 3.31
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LINC00682-201ENST00000498940 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
LINC00682-201ENST00000498940 CUX2O14529 1486 aa35.55■■■■□ 3.28
LINC00682-201ENST00000498940 SOGA1O94964 1423 aa35.47■■■■□ 3.27
LINC00682-201ENST00000498940 IFT140Q96RY7 1462 aa35.43■■■■□ 3.26
LINC00682-201ENST00000498940 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.4■■■■□ 3.26
LINC00682-201ENST00000498940 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
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LINC00682-201ENST00000498940 WDR97A6NE52 1622 aa35.25■■■■□ 3.23
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LINC00682-201ENST00000498940 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
LINC00682-201ENST00000498940 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
LINC00682-201ENST00000498940 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.08■■■■□ 3.21
LINC00682-201ENST00000498940 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.08■■■■□ 3.21
LINC00682-201ENST00000498940 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.07■■■■□ 3.2
LINC00682-201ENST00000498940 EEA1Q15075 1411 aa35.05■■■■□ 3.2
LINC00682-201ENST00000498940 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
LINC00682-201ENST00000498940 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.02■■■■□ 3.2
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LINC00682-201ENST00000498940 PBRM1Q86U86 1689 aa34.89■■■■□ 3.18
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LINC00682-201ENST00000498940 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.77■■■■□ 3.16
LINC00682-201ENST00000498940 CUL7Q14999 1698 aa34.75■■■■□ 3.15
LINC00682-201ENST00000498940 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.71■■■■□ 3.15
LINC00682-201ENST00000498940 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.71■■■■□ 3.15
LINC00682-201ENST00000498940 ADAMTS12P58397 1594 aa34.69■■■■□ 3.14
LINC00682-201ENST00000498940 PRXQ9BXM0 1461 aa34.68■■■■□ 3.14
LINC00682-201ENST00000498940 SYNJ2O15056 1496 aa34.64■■■■□ 3.14
LINC00682-201ENST00000498940 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.6■■■■□ 3.13
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LINC00682-201ENST00000498940 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
LINC00682-201ENST00000498940 FBLN2P98095 1184 aa34.51■■■■□ 3.11
LINC00682-201ENST00000498940 GRIN2AQ12879 1464 aa34.5■■■■□ 3.11
LINC00682-201ENST00000498940 GOLGA3Q08378 1498 aa34.45■■■■□ 3.1
LINC00682-201ENST00000498940 CHD1O14646 1710 aa34.42■■■■□ 3.1
LINC00682-201ENST00000498940 NUP160Q12769 1436 aa34.32■■■■□ 3.08
LINC00682-201ENST00000498940 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.3■■■■□ 3.08
LINC00682-201ENST00000498940 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
LINC00682-201ENST00000498940 CEP170Q5SW79 1584 aa34.27■■■■□ 3.08
LINC00682-201ENST00000498940 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.26■■■■□ 3.07
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