RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475087.5

COCH-205, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COCH, Length 1,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-205ENST00000475087 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.49■■■■■ 5.51
COCH-205ENST00000475087 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.52■■■■■ 4.56
COCH-205ENST00000475087 ABCC9O60706 1549 aa41.73■■■■■ 4.27
COCH-205ENST00000475087 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
COCH-205ENST00000475087 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41■■■■■ 4.15
COCH-205ENST00000475087 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.98■■■■■ 4.15
COCH-205ENST00000475087 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.79■■■■■ 4.12
COCH-205ENST00000475087 NACADO15069 1562 aa40.72■■■■■ 4.11
COCH-205ENST00000475087 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.52■■■■■ 4.08
COCH-205ENST00000475087 SCRIBQ14160 1630 aa39.82■■■■□ 3.96
COCH-205ENST00000475087 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.72■■■■□ 3.95
COCH-205ENST00000475087 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.6■■■■□ 3.93
COCH-205ENST00000475087 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.29■■■■□ 3.88
COCH-205ENST00000475087 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.19■■■■□ 3.86
COCH-205ENST00000475087 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.47■■■■□ 3.75
COCH-205ENST00000475087 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
COCH-205ENST00000475087 SMARCA4P51532 1647 aa38.18■■■■□ 3.7
COCH-205ENST00000475087 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.17■■■■□ 3.7
COCH-205ENST00000475087 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.17■■■■□ 3.7
COCH-205ENST00000475087 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
COCH-205ENST00000475087 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
COCH-205ENST00000475087 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.79■■■■□ 3.64
COCH-205ENST00000475087 WIZO95785 1651 aa37.79■■■■□ 3.64
COCH-205ENST00000475087 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.78■■■■□ 3.64
COCH-205ENST00000475087 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.76■■■■□ 3.63
COCH-205ENST00000475087 SMARCA2P51531 1590 aa37.73■■■■□ 3.63
COCH-205ENST00000475087 NCAPD3P42695 1498 aa37.59■■■■□ 3.61
COCH-205ENST00000475087 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.49■■■■□ 3.59
COCH-205ENST00000475087 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
COCH-205ENST00000475087 HMGXB3Q12766 1538 aa37.46■■■■□ 3.59
COCH-205ENST00000475087 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
COCH-205ENST00000475087 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.03■■■■□ 3.52
COCH-205ENST00000475087 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.55■■■■□ 3.44
COCH-205ENST00000475087 CFTRP13569 1480 aa36.53■■■■□ 3.44
COCH-205ENST00000475087 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.42■■■■□ 3.42
COCH-205ENST00000475087 NESP48681 1621 aa36.4■■■■□ 3.42
COCH-205ENST00000475087 PRDM2Q13029 1718 aa36.25■■■■□ 3.39
COCH-205ENST00000475087 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.15■■■■□ 3.38
COCH-205ENST00000475087 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.12■■■■□ 3.37
COCH-205ENST00000475087 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.97■■■■□ 3.35
COCH-205ENST00000475087 ABCC8Q09428 1581 aa35.96■■■■□ 3.35
COCH-205ENST00000475087 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.95■■■■□ 3.35
COCH-205ENST00000475087 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.91■■■■□ 3.34
COCH-205ENST00000475087 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.88■■■■□ 3.33
COCH-205ENST00000475087 ERCC6Q03468 1493 aa35.86■■■■□ 3.33
COCH-205ENST00000475087 CUX1P39880 1505 aa35.74■■■■□ 3.31
COCH-205ENST00000475087 SYNJ1O43426 1573 aa35.72■■■■□ 3.31
COCH-205ENST00000475087 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.71■■■■□ 3.31
COCH-205ENST00000475087 TRIM41Q8WV44 630 aa35.71■■■■□ 3.31
COCH-205ENST00000475087 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
COCH-205ENST00000475087 TOP2BQ02880 1626 aa35.67■■■■□ 3.3
COCH-205ENST00000475087 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.67■■■■□ 3.3
COCH-205ENST00000475087 TOPBP1Q92547 1522 aa35.65■■■■□ 3.3
COCH-205ENST00000475087 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.64■■■■□ 3.3
COCH-205ENST00000475087 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
COCH-205ENST00000475087 WDR62O43379 1518 aa35.56■■■■□ 3.28
COCH-205ENST00000475087 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.46■■■■□ 3.27
COCH-205ENST00000475087 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
COCH-205ENST00000475087 SOGA1O94964 1423 aa35.3■■■■□ 3.24
COCH-205ENST00000475087 CUX2O14529 1486 aa35.28■■■■□ 3.24
COCH-205ENST00000475087 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.27■■■■□ 3.24
COCH-205ENST00000475087 IFT140Q96RY7 1462 aa35.18■■■■□ 3.22
COCH-205ENST00000475087 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
COCH-205ENST00000475087 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.17■■■■□ 3.22
COCH-205ENST00000475087 WDR97A6NE52 1622 aa35.09■■■■□ 3.21
COCH-205ENST00000475087 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.06■■■■□ 3.2
COCH-205ENST00000475087 KIF27Q86VH2 1401 aa35.04■■■■□ 3.2
COCH-205ENST00000475087 EEA1Q15075 1411 aa35■■■■□ 3.19
COCH-205ENST00000475087 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
COCH-205ENST00000475087 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
COCH-205ENST00000475087 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
COCH-205ENST00000475087 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.92■■■■□ 3.18
COCH-205ENST00000475087 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.9■■■■□ 3.181e-11■■□□□ 14
COCH-205ENST00000475087 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.9■■■■□ 3.18
COCH-205ENST00000475087 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.85■■■■□ 3.17
COCH-205ENST00000475087 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
COCH-205ENST00000475087 IGF1RP08069 1367 aa34.82■■■■□ 3.16
COCH-205ENST00000475087 GRIN2BQ13224 1484 aa34.75■■■■□ 3.15
COCH-205ENST00000475087 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.75■■■■□ 3.15
COCH-205ENST00000475087 PBRM1Q86U86 1689 aa34.71■■■■□ 3.15
COCH-205ENST00000475087 PRXQ9BXM0 1461 aa34.63■■■■□ 3.13
COCH-205ENST00000475087 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.61■■■■□ 3.13
COCH-205ENST00000475087 CUL7Q14999 1698 aa34.6■■■■□ 3.13
COCH-205ENST00000475087 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.57■■■■□ 3.12
COCH-205ENST00000475087 KIF21BO75037 1637 aa34.56■■■■□ 3.12
COCH-205ENST00000475087 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
COCH-205ENST00000475087 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.52■■■■□ 3.12
COCH-205ENST00000475087 ADAMTS12P58397 1594 aa34.51■■■■□ 3.12
COCH-205ENST00000475087 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.5■■■■□ 3.11
COCH-205ENST00000475087 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.47■■■■□ 3.11
COCH-205ENST00000475087 GOLGA3Q08378 1498 aa34.44■■■■□ 3.1
COCH-205ENST00000475087 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.43■■■■□ 3.1
COCH-205ENST00000475087 SYNJ2O15056 1496 aa34.41■■■■□ 3.1
COCH-205ENST00000475087 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
COCH-205ENST00000475087 GRIN2AQ12879 1464 aa34.31■■■■□ 3.08
COCH-205ENST00000475087 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
COCH-205ENST00000475087 FBLN2P98095 1184 aa34.3■■■■□ 3.08
COCH-205ENST00000475087 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.21■■■■□ 3.07
COCH-205ENST00000475087 CHD1O14646 1710 aa34.19■■■■□ 3.06
COCH-205ENST00000475087 NUP160Q12769 1436 aa34.12■■■■□ 3.05
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