RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592623.5

RPS15-210, Transcript of ribosomal protein S15, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS15, Length 873 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS15-210ENST00000592623 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.91■■■■■ 5.9
RPS15-210ENST00000592623 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.29■■■■■ 5
RPS15-210ENST00000592623 ABCC9O60706 1549 aa45.72■■■■■ 4.91
RPS15-210ENST00000592623 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.83■■■■■ 4.61
RPS15-210ENST00000592623 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.71■■■■■ 4.59
RPS15-210ENST00000592623 NACADO15069 1562 aa43.67■■■■■ 4.58
RPS15-210ENST00000592623 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.26■■■■■ 4.52
RPS15-210ENST00000592623 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.5
RPS15-210ENST00000592623 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.92■■■■■ 4.46
RPS15-210ENST00000592623 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.7■■■■■ 4.43
RPS15-210ENST00000592623 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.66■■■■■ 4.42
RPS15-210ENST00000592623 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.39■■■■■ 4.38
RPS15-210ENST00000592623 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.25■■■■■ 4.35
RPS15-210ENST00000592623 SCRIBQ14160 1630 aa42.23■■■■■ 4.35
RPS15-210ENST00000592623 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.03■■■■■ 4.32
RPS15-210ENST00000592623 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.22
RPS15-210ENST00000592623 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.3■■■■■ 4.2
RPS15-210ENST00000592623 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.15■■■■■ 4.18
RPS15-210ENST00000592623 SMARCA4P51532 1647 aa40.34■■■■■ 4.05
RPS15-210ENST00000592623 NCAPD3P42695 1498 aa40.3■■■■■ 4.04
RPS15-210ENST00000592623 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
RPS15-210ENST00000592623 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.25■■■■■ 4.03
RPS15-210ENST00000592623 SMARCA2P51531 1590 aa40.22■■■■■ 4.03
RPS15-210ENST00000592623 HMGXB3Q12766 1538 aa40.05■■■■■ 4
RPS15-210ENST00000592623 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.97■■■■□ 3.99
RPS15-210ENST00000592623 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
RPS15-210ENST00000592623 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.93■■■■□ 3.98
RPS15-210ENST00000592623 ERCC6Q03468 1493 aa39.52■■■■□ 3.92
RPS15-210ENST00000592623 WIZO95785 1651 aa39.51■■■■□ 3.91
RPS15-210ENST00000592623 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
RPS15-210ENST00000592623 NESP48681 1621 aa39.4■■■■□ 3.9
RPS15-210ENST00000592623 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.29■■■■□ 3.88
RPS15-210ENST00000592623 CUX2O14529 1486 aa39.19■■■■□ 3.86
RPS15-210ENST00000592623 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.14■■■■□ 3.86
RPS15-210ENST00000592623 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.13■■■■□ 3.85
RPS15-210ENST00000592623 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
RPS15-210ENST00000592623 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.89■■■■□ 3.82
RPS15-210ENST00000592623 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
RPS15-210ENST00000592623 CFTRP13569 1480 aa38.79■■■■□ 3.8
RPS15-210ENST00000592623 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.69■■■■□ 3.78
RPS15-210ENST00000592623 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.68■■■■□ 3.78
RPS15-210ENST00000592623 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.67■■■■□ 3.78
RPS15-210ENST00000592623 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.66■■■■□ 3.78
RPS15-210ENST00000592623 WDR62O43379 1518 aa38.53■■■■□ 3.76
RPS15-210ENST00000592623 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.44■■■■□ 3.74
RPS15-210ENST00000592623 PRDM2Q13029 1718 aa38.38■■■■□ 3.73
RPS15-210ENST00000592623 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.25■■■■□ 3.71
RPS15-210ENST00000592623 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.25■■■■□ 3.71
RPS15-210ENST00000592623 ABCC8Q09428 1581 aa38.04■■■■□ 3.68
RPS15-210ENST00000592623 TOPBP1Q92547 1522 aa37.98■■■■□ 3.67
RPS15-210ENST00000592623 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.91■■■■□ 3.66
RPS15-210ENST00000592623 IFT140Q96RY7 1462 aa37.89■■■■□ 3.66
RPS15-210ENST00000592623 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
RPS15-210ENST00000592623 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
RPS15-210ENST00000592623 OSCARQ8IYS5 282 aa37.58■■■■□ 3.61
RPS15-210ENST00000592623 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
RPS15-210ENST00000592623 SOGA1O94964 1423 aa37.53■■■■□ 3.6
RPS15-210ENST00000592623 CUX1P39880 1505 aa37.52■■■■□ 3.6
RPS15-210ENST00000592623 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.59
RPS15-210ENST00000592623 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.5■■■■□ 3.59
RPS15-210ENST00000592623 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.48■■■■□ 3.59
RPS15-210ENST00000592623 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.46■■■■□ 3.594e-9■■□□□ 12.2
RPS15-210ENST00000592623 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
RPS15-210ENST00000592623 WDR97A6NE52 1622 aa37.29■■■■□ 3.56
RPS15-210ENST00000592623 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.23■■■■□ 3.55
RPS15-210ENST00000592623 FBLN2P98095 1184 aa37.22■■■■□ 3.55
RPS15-210ENST00000592623 GRIN2BQ13224 1484 aa37.13■■■■□ 3.54
RPS15-210ENST00000592623 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.12■■■■□ 3.53
RPS15-210ENST00000592623 TOP2BQ02880 1626 aa37.11■■■■□ 3.53
RPS15-210ENST00000592623 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.11■■■■□ 3.53
RPS15-210ENST00000592623 TRIM41Q8WV44 630 aa37.09■■■■□ 3.53
RPS15-210ENST00000592623 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.09■■■■□ 3.53
RPS15-210ENST00000592623 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.08■■■■□ 3.53
RPS15-210ENST00000592623 CHD1O14646 1710 aa37.08■■■■□ 3.53
RPS15-210ENST00000592623 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.52
RPS15-210ENST00000592623 SYNJ1O43426 1573 aa37.05■■■■□ 3.52
RPS15-210ENST00000592623 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
RPS15-210ENST00000592623 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.95■■■■□ 3.51
RPS15-210ENST00000592623 PBRM1Q86U86 1689 aa36.93■■■■□ 3.5
RPS15-210ENST00000592623 SYNJ2O15056 1496 aa36.93■■■■□ 3.5
RPS15-210ENST00000592623 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.87■■■■□ 3.49
RPS15-210ENST00000592623 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.87■■■■□ 3.49
RPS15-210ENST00000592623 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.87■■■■□ 3.49
RPS15-210ENST00000592623 ARHGEF11O15085 1522 aa36.86■■■■□ 3.49
RPS15-210ENST00000592623 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.69■■■■□ 3.46
RPS15-210ENST00000592623 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.68■■■■□ 3.46
RPS15-210ENST00000592623 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.65■■■■□ 3.46
RPS15-210ENST00000592623 ADAMTS12P58397 1594 aa36.65■■■■□ 3.46
RPS15-210ENST00000592623 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.63■■■■□ 3.45
RPS15-210ENST00000592623 GRIN2AQ12879 1464 aa36.62■■■■□ 3.45
RPS15-210ENST00000592623 KIF27Q86VH2 1401 aa36.51■■■■□ 3.44
RPS15-210ENST00000592623 ARAP1Q96P48 1450 aa36.51■■■■□ 3.44
RPS15-210ENST00000592623 NUP160Q12769 1436 aa36.46■■■■□ 3.43
RPS15-210ENST00000592623 CEP170Q5SW79 1584 aa36.4■■■■□ 3.42
RPS15-210ENST00000592623 IGF1RP08069 1367 aa36.35■■■■□ 3.41
RPS15-210ENST00000592623 CUL7Q14999 1698 aa36.26■■■■□ 3.4
RPS15-210ENST00000592623 JPH4Q96JJ6 628 aa36.18■■■■□ 3.38
RPS15-210ENST00000592623 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.17■■■■□ 3.38
RPS15-210ENST00000592623 SHROOM2Q13796 1616 aa36.17■■■■□ 3.38
RPS15-210ENST00000592623 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.6 ms