RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.45■■■■■ 5.67
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.39■■■■■ 4.7
MEIS3-212ENST00000561293 ABCC9O60706 1549 aa43.4■■■■■ 4.54
MEIS3-212ENST00000561293 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.36■■■■■ 4.37
MEIS3-212ENST00000561293 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
MEIS3-212ENST00000561293 NACADO15069 1562 aa41.67■■■■■ 4.26
MEIS3-212ENST00000561293 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.64■■■■■ 4.26
MEIS3-212ENST00000561293 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.53■■■■■ 4.24
MEIS3-212ENST00000561293 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.45■■■■■ 4.23
MEIS3-212ENST00000561293 SCRIBQ14160 1630 aa40.94■■■■■ 4.14
MEIS3-212ENST00000561293 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.81■■■■■ 4.12
MEIS3-212ENST00000561293 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.78■■■■■ 4.12
MEIS3-212ENST00000561293 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.64■■■■■ 4.1
MEIS3-212ENST00000561293 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.51■■■■■ 4.08
MEIS3-212ENST00000561293 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.49■■■■□ 3.91
MEIS3-212ENST00000561293 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.46■■■■□ 3.91
MEIS3-212ENST00000561293 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
MEIS3-212ENST00000561293 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.13■■■■□ 3.85
MEIS3-212ENST00000561293 SMARCA4P51532 1647 aa39.03■■■■□ 3.84
MEIS3-212ENST00000561293 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.03■■■■□ 3.84
MEIS3-212ENST00000561293 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39■■■■□ 3.83
MEIS3-212ENST00000561293 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
MEIS3-212ENST00000561293 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.73■■■■□ 3.79
MEIS3-212ENST00000561293 WIZO95785 1651 aa38.64■■■■□ 3.78
MEIS3-212ENST00000561293 SMARCA2P51531 1590 aa38.56■■■■□ 3.76
MEIS3-212ENST00000561293 NCAPD3P42695 1498 aa38.52■■■■□ 3.76
MEIS3-212ENST00000561293 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.5■■■■□ 3.75
MEIS3-212ENST00000561293 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
MEIS3-212ENST00000561293 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
MEIS3-212ENST00000561293 HMGXB3Q12766 1538 aa38.33■■■■□ 3.73
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MEIS3-212ENST00000561293 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.78■■■■□ 3.64
MEIS3-212ENST00000561293 NESP48681 1621 aa37.74■■■■□ 3.63
MEIS3-212ENST00000561293 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.51■■■■□ 3.6
MEIS3-212ENST00000561293 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.38■■■■□ 3.57
MEIS3-212ENST00000561293 CFTRP13569 1480 aa37.37■■■■□ 3.57
MEIS3-212ENST00000561293 ERCC6Q03468 1493 aa37.26■■■■□ 3.56
MEIS3-212ENST00000561293 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.17■■■■□ 3.54
MEIS3-212ENST00000561293 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.15■■■■□ 3.54
MEIS3-212ENST00000561293 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.13■■■■□ 3.53
MEIS3-212ENST00000561293 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.98■■■■□ 3.51
MEIS3-212ENST00000561293 PRDM2Q13029 1718 aa36.95■■■■□ 3.51
MEIS3-212ENST00000561293 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
MEIS3-212ENST00000561293 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.8■■■■□ 3.48
MEIS3-212ENST00000561293 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
MEIS3-212ENST00000561293 ABCC8Q09428 1581 aa36.69■■■■□ 3.46
MEIS3-212ENST00000561293 WDR62O43379 1518 aa36.63■■■■□ 3.45
MEIS3-212ENST00000561293 TOPBP1Q92547 1522 aa36.58■■■■□ 3.45
MEIS3-212ENST00000561293 CUX1P39880 1505 aa36.55■■■■□ 3.44
MEIS3-212ENST00000561293 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.49■■■■□ 3.43
MEIS3-212ENST00000561293 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.48■■■■□ 3.43
MEIS3-212ENST00000561293 CUX2O14529 1486 aa36.45■■■■□ 3.43
MEIS3-212ENST00000561293 SYNJ1O43426 1573 aa36.42■■■■□ 3.42
MEIS3-212ENST00000561293 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
MEIS3-212ENST00000561293 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.34■■■■□ 3.41
MEIS3-212ENST00000561293 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.3■■■■□ 3.4
MEIS3-212ENST00000561293 TOP2BQ02880 1626 aa36.25■■■■□ 3.39
MEIS3-212ENST00000561293 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.2■■■■□ 3.38
MEIS3-212ENST00000561293 SOGA1O94964 1423 aa36.19■■■■□ 3.38
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
MEIS3-212ENST00000561293 IFT140Q96RY7 1462 aa36.12■■■■□ 3.37
MEIS3-212ENST00000561293 TRIM41Q8WV44 630 aa36.1■■■■□ 3.37
MEIS3-212ENST00000561293 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
MEIS3-212ENST00000561293 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
MEIS3-212ENST00000561293 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.04■■■■□ 3.36
MEIS3-212ENST00000561293 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.03■■■■□ 3.36
MEIS3-212ENST00000561293 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
MEIS3-212ENST00000561293 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.89■■■■□ 3.34
MEIS3-212ENST00000561293 WDR97A6NE52 1622 aa35.87■■■■□ 3.33
MEIS3-212ENST00000561293 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.75■■■■□ 3.31
MEIS3-212ENST00000561293 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.73■■■■□ 3.31
MEIS3-212ENST00000561293 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.71■■■■□ 3.31
MEIS3-212ENST00000561293 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.63■■■■□ 3.29
MEIS3-212ENST00000561293 GRIN2BQ13224 1484 aa35.62■■■■□ 3.29
MEIS3-212ENST00000561293 KIF27Q86VH2 1401 aa35.62■■■■□ 3.29
MEIS3-212ENST00000561293 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
MEIS3-212ENST00000561293 FBLN2P98095 1184 aa35.6■■■■□ 3.29
MEIS3-212ENST00000561293 PBRM1Q86U86 1689 aa35.58■■■■□ 3.29
MEIS3-212ENST00000561293 IGF1RP08069 1367 aa35.49■■■■□ 3.27
MEIS3-212ENST00000561293 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.42■■■■□ 3.26
MEIS3-212ENST00000561293 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
MEIS3-212ENST00000561293 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
MEIS3-212ENST00000561293 ADAMTS12P58397 1594 aa35.36■■■■□ 3.25
MEIS3-212ENST00000561293 CHD1O14646 1710 aa35.34■■■■□ 3.25
MEIS3-212ENST00000561293 SYNJ2O15056 1496 aa35.33■■■■□ 3.25
MEIS3-212ENST00000561293 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.32■■■■□ 3.25
MEIS3-212ENST00000561293 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.3■■■■□ 3.24
MEIS3-212ENST00000561293 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.28■■■■□ 3.24
MEIS3-212ENST00000561293 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.25■■■■□ 3.23
MEIS3-212ENST00000561293 OSCARQ8IYS5 282 aa35.22■■■■□ 3.23
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MEIS3-212ENST00000561293 CUL7Q14999 1698 aa35.17■■■■□ 3.22
MEIS3-212ENST00000561293 EEA1Q15075 1411 aa35.12■■■■□ 3.21
MEIS3-212ENST00000561293 PRXQ9BXM0 1461 aa35.08■■■■□ 3.21
MEIS3-212ENST00000561293 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.07■■■■□ 3.2
MEIS3-212ENST00000561293 CEP170Q5SW79 1584 aa35.07■■■■□ 3.2
MEIS3-212ENST00000561293 NUP160Q12769 1436 aa34.98■■■■□ 3.19
MEIS3-212ENST00000561293 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.92■■■■□ 3.18
MEIS3-212ENST00000561293 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.9■■■■□ 3.18
MEIS3-212ENST00000561293 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
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