Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC42Q9Y546 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC42Q9Y546 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC42Q9Y546 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC42Q9Y546 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC42Q9Y546 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC42Q9Y546 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC42Q9Y546 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC42Q9Y546 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC42Q9Y546 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC42Q9Y546 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC42Q9Y546 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC42Q9Y546 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC42Q9Y546 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC42Q9Y546 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC42Q9Y546 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC42Q9Y546 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC42Q9Y546 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC42Q9Y546 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC42Q9Y546 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC42Q9Y546 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC42Q9Y546 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC42Q9Y546 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC42Q9Y546 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC42Q9Y546 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC42Q9Y546 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC42Q9Y546 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC42Q9Y546 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC42Q9Y546 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC42Q9Y546 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC42Q9Y546 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC42Q9Y546 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC42Q9Y546 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC42Q9Y546 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC42Q9Y546 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC42Q9Y546 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC42Q9Y546 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC42Q9Y546 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC42Q9Y546 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC42Q9Y546 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC42Q9Y546 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC42Q9Y546 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC42Q9Y546 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC42Q9Y546 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC42Q9Y546 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC42Q9Y546 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC42Q9Y546 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC42Q9Y546 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC42Q9Y546 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC42Q9Y546 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC42Q9Y546 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC42Q9Y546 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC42Q9Y546 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC42Q9Y546 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC42Q9Y546 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC42Q9Y546 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms