Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKP3Q9Y446 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKP3Q9Y446 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKP3Q9Y446 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKP3Q9Y446 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKP3Q9Y446 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKP3Q9Y446 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKP3Q9Y446 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKP3Q9Y446 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKP3Q9Y446 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKP3Q9Y446 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP3Q9Y446 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKP3Q9Y446 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKP3Q9Y446 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKP3Q9Y446 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKP3Q9Y446 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKP3Q9Y446 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKP3Q9Y446 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKP3Q9Y446 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PKP3Q9Y446 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PKP3Q9Y446 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKP3Q9Y446 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKP3Q9Y446 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms