Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FNDC3AQ9Y2H6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FNDC3AQ9Y2H6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FNDC3AQ9Y2H6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FNDC3AQ9Y2H6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FNDC3AQ9Y2H6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FNDC3AQ9Y2H6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FNDC3AQ9Y2H6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FNDC3AQ9Y2H6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FNDC3AQ9Y2H6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FNDC3AQ9Y2H6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FNDC3AQ9Y2H6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNDC3AQ9Y2H6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNDC3AQ9Y2H6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNDC3AQ9Y2H6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FNDC3AQ9Y2H6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FNDC3AQ9Y2H6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FNDC3AQ9Y2H6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FNDC3AQ9Y2H6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FNDC3AQ9Y2H6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FNDC3AQ9Y2H6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FNDC3AQ9Y2H6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FNDC3AQ9Y2H6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FNDC3AQ9Y2H6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FNDC3AQ9Y2H6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FNDC3AQ9Y2H6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FNDC3AQ9Y2H6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FNDC3AQ9Y2H6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FNDC3AQ9Y2H6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FNDC3AQ9Y2H6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FNDC3AQ9Y2H6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FNDC3AQ9Y2H6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FNDC3AQ9Y2H6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FNDC3AQ9Y2H6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FNDC3AQ9Y2H6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FNDC3AQ9Y2H6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FNDC3AQ9Y2H6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FNDC3AQ9Y2H6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FNDC3AQ9Y2H6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FNDC3AQ9Y2H6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FNDC3AQ9Y2H6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FNDC3AQ9Y2H6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FNDC3AQ9Y2H6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FNDC3AQ9Y2H6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FNDC3AQ9Y2H6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FNDC3AQ9Y2H6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FNDC3AQ9Y2H6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms