Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQQ2

SH2B3, SH2B adapter protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B3Q9UQQ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2B3Q9UQQ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2B3Q9UQQ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2B3Q9UQQ2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2B3Q9UQQ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B3Q9UQQ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B3Q9UQQ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B3Q9UQQ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B3Q9UQQ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B3Q9UQQ2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2B3Q9UQQ2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH2B3Q9UQQ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH2B3Q9UQQ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2B3Q9UQQ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B3Q9UQQ2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B3Q9UQQ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B3Q9UQQ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B3Q9UQQ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B3Q9UQQ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2B3Q9UQQ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2B3Q9UQQ2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B3Q9UQQ2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B3Q9UQQ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B3Q9UQQ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B3Q9UQQ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH2B3Q9UQQ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH2B3Q9UQQ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SH2B3Q9UQQ2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2B3Q9UQQ2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.4 ms