Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SORCS3Q9UPU3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SORCS3Q9UPU3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SORCS3Q9UPU3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SORCS3Q9UPU3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SORCS3Q9UPU3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SORCS3Q9UPU3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SORCS3Q9UPU3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SORCS3Q9UPU3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SORCS3Q9UPU3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SORCS3Q9UPU3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SORCS3Q9UPU3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SORCS3Q9UPU3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SORCS3Q9UPU3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SORCS3Q9UPU3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SORCS3Q9UPU3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SORCS3Q9UPU3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SORCS3Q9UPU3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SORCS3Q9UPU3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SORCS3Q9UPU3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SORCS3Q9UPU3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SORCS3Q9UPU3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SORCS3Q9UPU3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SORCS3Q9UPU3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SORCS3Q9UPU3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SORCS3Q9UPU3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SORCS3Q9UPU3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SORCS3Q9UPU3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SORCS3Q9UPU3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SORCS3Q9UPU3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SORCS3Q9UPU3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SORCS3Q9UPU3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SORCS3Q9UPU3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SORCS3Q9UPU3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SORCS3Q9UPU3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SORCS3Q9UPU3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms