Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF223Q9UK11 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF223Q9UK11 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF223Q9UK11 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF223Q9UK11 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF223Q9UK11 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF223Q9UK11 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF223Q9UK11 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF223Q9UK11 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF223Q9UK11 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF223Q9UK11 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF223Q9UK11 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF223Q9UK11 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF223Q9UK11 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF223Q9UK11 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF223Q9UK11 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF223Q9UK11 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF223Q9UK11 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF223Q9UK11 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF223Q9UK11 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF223Q9UK11 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF223Q9UK11 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF223Q9UK11 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF223Q9UK11 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF223Q9UK11 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF223Q9UK11 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF223Q9UK11 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF223Q9UK11 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF223Q9UK11 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF223Q9UK11 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF223Q9UK11 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF223Q9UK11 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF223Q9UK11 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF223Q9UK11 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF223Q9UK11 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF223Q9UK11 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF223Q9UK11 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF223Q9UK11 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF223Q9UK11 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF223Q9UK11 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF223Q9UK11 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms