Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGA2Q9UJY4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GGA2Q9UJY4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGA2Q9UJY4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGA2Q9UJY4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGA2Q9UJY4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGA2Q9UJY4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GGA2Q9UJY4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GGA2Q9UJY4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GGA2Q9UJY4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGA2Q9UJY4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGA2Q9UJY4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGA2Q9UJY4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA2Q9UJY4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA2Q9UJY4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GGA2Q9UJY4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GGA2Q9UJY4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA2Q9UJY4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA2Q9UJY4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA2Q9UJY4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA2Q9UJY4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA2Q9UJY4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGA2Q9UJY4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGA2Q9UJY4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGA2Q9UJY4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGA2Q9UJY4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGA2Q9UJY4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGA2Q9UJY4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GGA2Q9UJY4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGA2Q9UJY4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGA2Q9UJY4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGA2Q9UJY4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GGA2Q9UJY4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GGA2Q9UJY4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGA2Q9UJY4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA2Q9UJY4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA2Q9UJY4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA2Q9UJY4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA2Q9UJY4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GGA2Q9UJY4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GGA2Q9UJY4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GGA2Q9UJY4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA2Q9UJY4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA2Q9UJY4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA2Q9UJY4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA2Q9UJY4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA2Q9UJY4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA2Q9UJY4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA2Q9UJY4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGA2Q9UJY4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGA2Q9UJY4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA2Q9UJY4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GGA2Q9UJY4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGA2Q9UJY4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGA2Q9UJY4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GGA2Q9UJY4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GGA2Q9UJY4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GGA2Q9UJY4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GGA2Q9UJY4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GGA2Q9UJY4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GGA2Q9UJY4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms