Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNAI1Q9UI46 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNAI1Q9UI46 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNAI1Q9UI46 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNAI1Q9UI46 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNAI1Q9UI46 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNAI1Q9UI46 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNAI1Q9UI46 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNAI1Q9UI46 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNAI1Q9UI46 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNAI1Q9UI46 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNAI1Q9UI46 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNAI1Q9UI46 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNAI1Q9UI46 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNAI1Q9UI46 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNAI1Q9UI46 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNAI1Q9UI46 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNAI1Q9UI46 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAI1Q9UI46 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAI1Q9UI46 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAI1Q9UI46 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAI1Q9UI46 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNAI1Q9UI46 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNAI1Q9UI46 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNAI1Q9UI46 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNAI1Q9UI46 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNAI1Q9UI46 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNAI1Q9UI46 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNAI1Q9UI46 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAI1Q9UI46 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAI1Q9UI46 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAI1Q9UI46 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNAI1Q9UI46 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNAI1Q9UI46 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNAI1Q9UI46 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DNAI1Q9UI46 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DNAI1Q9UI46 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNAI1Q9UI46 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNAI1Q9UI46 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNAI1Q9UI46 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNAI1Q9UI46 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNAI1Q9UI46 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNAI1Q9UI46 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNAI1Q9UI46 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNAI1Q9UI46 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNAI1Q9UI46 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNAI1Q9UI46 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNAI1Q9UI46 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
DNAI1Q9UI46 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNAI1Q9UI46 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms