Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPN3Q9UHW5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPN3Q9UHW5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPN3Q9UHW5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPN3Q9UHW5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GPN3Q9UHW5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPN3Q9UHW5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPN3Q9UHW5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPN3Q9UHW5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPN3Q9UHW5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPN3Q9UHW5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPN3Q9UHW5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPN3Q9UHW5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPN3Q9UHW5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPN3Q9UHW5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPN3Q9UHW5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPN3Q9UHW5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPN3Q9UHW5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPN3Q9UHW5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPN3Q9UHW5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPN3Q9UHW5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPN3Q9UHW5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GPN3Q9UHW5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPN3Q9UHW5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPN3Q9UHW5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPN3Q9UHW5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPN3Q9UHW5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GPN3Q9UHW5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPN3Q9UHW5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPN3Q9UHW5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.6 ms