Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC88CQ9P219 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC88CQ9P219 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC88CQ9P219 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC88CQ9P219 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC88CQ9P219 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC88CQ9P219 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC88CQ9P219 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC88CQ9P219 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC88CQ9P219 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC88CQ9P219 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC88CQ9P219 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC88CQ9P219 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC88CQ9P219 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC88CQ9P219 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC88CQ9P219 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC88CQ9P219 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC88CQ9P219 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC88CQ9P219 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC88CQ9P219 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC88CQ9P219 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC88CQ9P219 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC88CQ9P219 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC88CQ9P219 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC88CQ9P219 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC88CQ9P219 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC88CQ9P219 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC88CQ9P219 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC88CQ9P219 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC88CQ9P219 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
CCDC88CQ9P219 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC88CQ9P219 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC88CQ9P219 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC88CQ9P219 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC88CQ9P219 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC88CQ9P219 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC88CQ9P219 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC88CQ9P219 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC88CQ9P219 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC88CQ9P219 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC88CQ9P219 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC88CQ9P219 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC88CQ9P219 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC88CQ9P219 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms