Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRACLQ9P1F3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRACLQ9P1F3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRACLQ9P1F3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRACLQ9P1F3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRACLQ9P1F3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRACLQ9P1F3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRACLQ9P1F3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRACLQ9P1F3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRACLQ9P1F3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRACLQ9P1F3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRACLQ9P1F3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABRACLQ9P1F3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABRACLQ9P1F3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABRACLQ9P1F3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABRACLQ9P1F3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABRACLQ9P1F3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABRACLQ9P1F3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABRACLQ9P1F3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABRACLQ9P1F3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABRACLQ9P1F3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABRACLQ9P1F3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABRACLQ9P1F3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABRACLQ9P1F3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABRACLQ9P1F3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRACLQ9P1F3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRACLQ9P1F3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABRACLQ9P1F3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABRACLQ9P1F3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ABRACLQ9P1F3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABRACLQ9P1F3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABRACLQ9P1F3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABRACLQ9P1F3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABRACLQ9P1F3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABRACLQ9P1F3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABRACLQ9P1F3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABRACLQ9P1F3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABRACLQ9P1F3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABRACLQ9P1F3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABRACLQ9P1F3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABRACLQ9P1F3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABRACLQ9P1F3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABRACLQ9P1F3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRACLQ9P1F3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABRACLQ9P1F3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms