Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL39Q9NYK5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL39Q9NYK5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL39Q9NYK5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL39Q9NYK5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL39Q9NYK5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL39Q9NYK5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL39Q9NYK5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL39Q9NYK5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL39Q9NYK5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL39Q9NYK5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL39Q9NYK5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MRPL39Q9NYK5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL39Q9NYK5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL39Q9NYK5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms