Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUC0

SERTAD4, SERTA domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERTAD4Q9NUC0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERTAD4Q9NUC0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERTAD4Q9NUC0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERTAD4Q9NUC0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERTAD4Q9NUC0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SERTAD4Q9NUC0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERTAD4Q9NUC0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERTAD4Q9NUC0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERTAD4Q9NUC0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERTAD4Q9NUC0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms